血清β2-微球蛋白的升高可反映腎小球濾過功能受損或濾過負荷是否增加的情況；而尿液中排出β2-微球蛋白增高，則提示腎小管損害或濾過負荷增加；在急慢性腎盂腎炎時，因腎臟受損，故尿β2-微球蛋白升高，而膀胱炎患者則β2—微球蛋白正常；腎移植患者血、尿β2—微球蛋白明顯增高，提示機體發生排斥反應，因β2—微球蛋白合成加速，雖腎清除增多，而血β2—微球蛋白仍增高。
一般在移植后2~3天血β2—微球蛋白上升至高峰，隨后逐漸下降。腎移植后連續測定血、尿β2—微球蛋白可作為腎小球和腎小管病變的敏感指標。如腎移植雖有少尿，但血β2—微球蛋白下降者提示預后良好。排異時血β2—微球蛋白增高先于Cr，測定β2—微球蛋白，有助于診斷尚處于亞臨床期腎發生的排斥反應。