產堿桿菌屬 Alcaligenes
| 糞產堿桿菌 | A．faecalis |
脫硝產堿桿菌 | A．denitricans |
皮埃查德產堿桿菌 | A．piechaudii |
莫拉氏菌屬 Moraxella
| 亞特蘭大莫拉氏菌 | M．atlantae |
腔隙莫拉氏菌 | M．1acunata |
非液化莫拉氏菌 | M．nonliquefaciens |
艾肯氏菌屬 Elkenella
| 侵蝕艾肯氏菌 | E．corrodens |
鮑特氏菌屬 Bordetella
| 百日咳鮑特氏菌 | B．pertussis |
副百日咳鮑特氏菌 | B．parapertussis |
支氣管鮑特氏菌， | B．bronchisptica? |
巴斯德氏菌屬 Pasteurella
| 多殺巴斯德氏菌 | P．mnltocida |
嗜肺巴斯德氏菌 | P．pneyumotropica |
溶血巴斯德氏菌 | P．urea |
脲巴斯德氏菌 | P．urea |
產氣巴斯德氏菌 | P．aerogenes |
母雞巴斯德氏菌 | P．gallinarum |
心臟桿菌屬 Cardiobacterium
| 人心臟桿菌屬 | C．hominis |
色桿菌屬 Chromobacterium
| 紫色色桿菌屬 | C．violaceum |
黃單胞菌屬 Xanthomonas
| 嗜麥芽黃單胞菌 | X．maltophilia |
布魯氏菌屬 Brucella
| 羊布魯氏菌 | B．melitensis |
牛布魯氏菌 | B．abortu |
豬布魯氏菌 | B．suis |
綿羊布魯氏菌 | B．ovis |
木鼠布魯氏菌 | B．neotimac |
狗布魯氏菌 | B．canis |
消化球菌屬 Peptococcus
| 黑色消化球菌 | P．niger |
消化鏈球菌屬 Peptostreptoeoccus
| 厭氧消化鏈球菌 | P．anaerrobius |
不解糖消化鏈球菌 | P．asacchdrolyticus |
產吲哚消化鏈球菌 | P．indolicus |
四聯消化鏈球菌 | P．tetradius |
大消化鏈球菌 | P．magnus |
微小消化鏈球菌 | P．micros |
普氏消化鏈球菌 | P．prevotii |
產生消化鏈球菌 | P．productus |
韋榮氏球菌屬 Vellonea
| 細小韋榮氏菌 | Y．parvula |
齒蝕韋榮氏菌 | Y．rodentium |
不典型韋榮氏菌 | Y．atypica |
差異韋榮氏菌 | Y．dispar |
擬桿菌屬Bactericxles
| 不解糖擬桿菌 | P．asaccharolyticus |
齒齦擬桿菌 | P．gingivalis |
解脲擬桿菌 | B．ureolyticus |
中間型擬桿菌 | B．intermedius |
人體擬桿菌 | B．corporis |
吉氏擬桿菌 | B．distasonis |
條形擬桿菌 | B．grecilis |
普通擬桿菌 | B．vulgatus |
卵形擬桿菌 | B．ovatus |
多形擬桿菌 | B．thetaiotaomicron |
規則擬桿菌 | B．uniformis |
艾格斯擬桿菌 | B．eggerthii |
內臟擬桿菌 | B．splanchnicus |
口腔擬桿菌 | B．oris |
口生擬桿菌 | B．buccac |
菌膠團擬桿菌 | B．zoogleoformans |
口源擬桿菌 | B．oralis |
雙向擬桿菌 | B．disiens |
多毛擬桿菌 | B．capillosus |
銳利擬桿菌 | B．pracacutus |
腐敗擬桿菌 | B．putredinis |
產黑色素擬桿菌 | B．mclaninogenicus |
住齒擬桿菌 | B．denticula |
勞艾奇擬桿菌 | B．loeschcii |
梭桿菌屬 Fusobacterium
| 核梭桿菌 | F．nuclcatum |
壞死梭桿菌 | F．necrophorum |
舟形梭桿菌 | F．naviforme |
變形梭桿菌 | F．varium |
死亡梭桿菌 | F．mortiferum |
拉氏梭桿菌 | F．russii |
芽孢梭菌屬
| 肉毒芽孢梭菌 | C．botulinum |
雙酶芽孢梭菌 | C．bifermetans |
丁酸芽孢梭菌 | C．butyricum |
尸毒芽孢梭菌 | C．cadaveris |
梭形芽孢梭菌 | C．clostridioforme |
難辨芽孢梭菌 | C．difficile |
溶組織芽孢梭菌 | C．histolyticum |
無害芽孢梭菌 | C．innocuum |
泥潭芽孢梭菌 | C．limosum |
諾氏芽孢梭菌 | C．novyi |
產氣莢膜芽孢梭菌 | C．perfringens |
副產氣莢膜芽孢梭菌 | C．paraperfringens |
多枝芽孢梭菌 | C．ramosum |
敗毒芽孢梭菌 | C．septicum |
索氏芽孢梭菌 | C．sordcllii |
產芽孢胞孢梭菌 | C．sporogenes |
次端芽孢梭菌 | C．subterminalc |
第三芽孢梭菌 | C．tertium |
破傷風芽孢梭菌 | C．tetani |
楔形芽孢梭菌 | C．sphenoidos |
念珠菌屬 Candida
| 白色念珠菌 | C．albicans |
熱帶念珠菌 | C．tropicalis |
偽熱帶念珠菌 | C．pseudotropicalis |
高里氏念珠菌 | C．gulliermondii |
類星形念珠菌 | C．stellatoidea |
皺折念珠菌 | C．rugosa |
近平滑念珠菌 | C．gu6rdcd |
隱球菌屬 Cryptococcus
| 新型隱球菌 | C．meoformans |
白色隱球菌 | C．albidns |
胃隱球菌 | C．gastricus |
羅倫隱球菌 | C．Iaurentii |
淺黃隱球菌 | C．Inteohts： |
地生隱球菌 | C．terrcus |
指甲隱球菌 | C．uniguttulatus |