中國學者解析甜瓜全基因組變異圖譜及進化機制

　　 近日，Nature Genetics線發表了中國農科院與其它機構合作完成的兩篇重量級文章，文章分別構建了甜瓜全基因組變異圖譜和解析了西瓜果實品質性狀進化分子機制。

　　鑒于該兩項研究的重要性，Nature Genetics雜志還同期發表了題為“Sweet genes in melon and watermelon”的專評文章和以“Sweet sequencing”為題的社論文章。

　　在第一篇文章“Resequencing of 414 cultivated and wild watermelon accessions identifies selection for fruit quality traits”中，北京市農林科學院許勇團隊、中國農科院鄭州果樹所劉文革團隊、美國康奈爾大學Boyce Thompson研究所費章君團隊和中國農科院深圳基因組所黃三文團隊等合作，完成了新一代西瓜基因組精細圖譜繪制和馴化歷史解析，首次系統揭示了西瓜果實品質性狀進化的分子機制。

　　甜西瓜的水果特性在很大程度上是人類選擇的結果。

　　在這篇文章中，作者報告了一個改良版的西瓜參考基因組和414份西瓜屬所有現存物種代表材料的全基因組重測序。群體基因組學分析揭示了西瓜屬的演化歷史，說明了阿瑪魯西瓜（Citrullus amarus）和包含西瓜（Citrullus lanatus）和黏籽西瓜（Citrullus mucosospermus）支系的獨立演化。

　　研究發現表明，在物種形成、馴化和改良過程中，影響西瓜果實大小的基因組上不同位點都受到了選擇。起源于甜西瓜的非苦味等位基因在西瓜群體中很大程度上被固定下來。果肉甜度的選擇起始于西瓜的祖先，并通過控制棉子糖分解代謝和糖運輸基因座的現代育種持續選擇。果肉著色和糖分積累可能通過包括糖轉運蛋白基因在內的共有遺傳成分共同演化。這一研究提供了寶貴的基因組資源，并為西瓜的物種形成和育種歷史提供了新的視野。（內容來自科學網博客）

　　第二篇文章“A comprehensive genome variation map of melon identifies multiple domestication events and loci influencing agronomic traits”由中國農業科學院鄭州果樹研究所徐永陽團隊、中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊、西班牙巴塞羅那食品科學院JordiGarcia-Mas團隊等合作完成。

　　這項研究標志著我國在甜瓜基因組學和群體遺傳學研究領域取得重大進展，為深化葫蘆科進化研究提供了重要依據，為甜瓜重要性狀定向育種和遺傳改良提供了較為精準的標記和基因資源。