國際著名學術雜志《Cell》子刊《Molecular Plant》雜志在線發表了中國農業科學院作物科學研究所何忠虎研究組的評述性論文“作物育種芯片與基因型鑒定平臺:進展、挑戰與展望”(Crop breeding chips and genotyping platforms: progress, challenges and perspectives),論文對作物分子標記發展概況、分子育種進展、基因型與表型關系、現有高通量基因型檢測平臺利弊、育種芯片的高通量與靈活性等方面進行了系統評述分析,認為隨著基因組學技術的發展,分子標記在作物遺傳育種領域應用將更加廣泛。目前在25種作物中已開發出50多種SNP芯片及15種基于測序技術的基因型檢測平臺,但真正符合育種家需要的并不多,為此提出了發展高通量、低成本兼具靈活性的實用分子育種平臺策略,將極大提高育種效率,加速培育適應全球氣候變化的作物新品種。
SNP芯片已成為作物遺傳改良的重要工具。該團隊在前期成功開發小麥KASP基因型檢測平臺的基礎上,與公司合作研制出新型50K小麥育種芯片,概括起來有四大優點:(1)標記多態性高、應用范圍廣,適用于不同遺傳背景的小麥材料檢測;(2)標記分布均勻,每條染色體含2000多個SNP標記;(3)含功能基因及與性狀連鎖標記,包括135個品質、農藝性狀和抗病性等基因標記及與重要性狀緊密連鎖的700個標記,這是其它芯片不具備的;(4)比同類芯片價格低20%。
Mol Plant:中科院作物所何忠虎研究組發表育種芯片評述性論文