1、乙肝免疫球蛋白可能導致乙肝病毒變異，產生乙肝病毒免疫逃逸株，給治療和預防帶來困難；此外如果該免疫逃逸株在人群中傳播，現行的乙肝疫苗將無法預防，這是十分危險的。
2、引起嬰幼兒接種疫苗失敗，引起母腎的功能負擔。
3、在肝移植患者中，靜脈滴注乙肝免疫球蛋白有可能會發生惡心、皮疹、風疹、紅斑、關節痛、注射局部疼痛、過敏，用抗組胺類藥物和普通止痛藥配合使用能有效控制以上癥狀。
4、接受高劑量靜脈滴注乙肝免疫球蛋白的患者，血漿汞濃度升高會出現偏執、說話困難、雙手震顫等癥狀，此外還應該警惕汞中毒。
5、乙肝患者注射乙肝免疫球蛋白，有可能在其體內形成乙肝病毒抗原-抗體免疫復合物，這種免疫復合物有可能晨起在乙肝病毒感染者體內的重要臟器中，引起免疫反映，導致乙肝并發癥。