乙肝e抗原（HBeAg）
乙肝e抗原（HBeAg）是乙肝病毒內核的一種主要結構蛋白，它的一級結構與乙肝核心抗原(HBcAg)基本相同，是一種可溶性抗原，有3個亞型分別為：e1、e2、e3。乙肝E抗原是急性感染的早期標志，在潛伏期乃至整個病程中，乙肝e抗原均可檢出。它的檢出可作為DNA多聚酶和環狀DNA分子存在的標志，表示肝細胞有進行性損害和高度傳染性。乙肝E抗體是乙肝E抗原的相應抗體，一般認為乙肝E抗原消失和乙肝E抗體出現是病情趨于好轉的征象，但并不意味著乙肝病毒DNA停止復制或傳染性消失。
關于肝e抗原陰性的情況主要有以下幾種：
1、健康人。從未感染過乙肝病毒，體內不存在乙肝病毒，也不就存在乙肝病毒的復制，所以乙肝e抗原呈陰性。
2、慢性乙肝攜帶者。體內攜帶有乙肝病毒，但是病毒含量少，病毒復制不活躍，傳染性小。
3、乙肝恢復期。經過藥物治療，或由于自身的免疫力強，憑借自身的系統，清除體內一大部分乙肝病毒，但是還沒有徹底清除完體內病毒，所以正處于乙肝的恢復期。
乙肝e抗體（HBeAb）
乙肝e抗體（HBeAb）又稱為抗-Hbe，英文縮寫是HBeAb。乙肝e抗體是人體感染乙肝病毒后，繼乙肝核心抗體產生而出現的另一抗體，是乙肝病毒感染的又一標志物，在HBeAg轉陰后數月出現HBeAb陽性。一般來說，HBeAb陽性預示患者的傳染性已顯著或相對降低。病毒復制程度已降低或明顯緩解。但近年發現許多HBeAb陽性，乙肝病毒脫氧核糖核酸（HBVDNA）亦為陽性的異型乙肝患者，其病情遷延不愈。這是感染了變異的乙肝病毒所致，臨床上不可忽視。但也有學者認為HBeAb的產生，只意味著乙肝病毒大部分被清除，但并不意味著慢性肝炎的痊愈。
1.HBeAb并不是一種保護性抗體，HBeAb的出現一般代表著乙肝病毒復制減少或已基本停止。如果乙肝患者出現HBeAb陽性也不能掉以輕心，需要根據乙肝HBV-DNA檢測做進一步的判斷。
2.HBeAb陽性的患者，如果HBV-DNA檢測陰性則說明體內乙肝病毒復制減少，傳染性弱；如果HBV-DNA檢測為陽性，則說明體內還存在病毒大量復制，有可能是病毒變異的結果，需要做進一步的治療。
臨床意義
HBeAg在乙型肝炎潛伏期的后期出現，略晚于HBsAg的出現，而消失較早，與HBV-DNA密切相關。其臨床意義為：
(1)可作為急性乙肝輔助診斷和預后指標，急性乙肝進入恢復期常隨HBsAg的消失而消失。如果急性乙肝發病后3-4個月，HBeAg由陽轉陰，抗-HBE出現，表示預后良好.起病3-6個月，仍HBeAg陽性，可能是急性肝炎轉為慢性的最早證據。
(2)有助于判斷乙肝患者或HBV攜帶者的傳染性強弱。HBeAg存在于HBsAg陽性者血清中，說明血液中有乙型肝炎病毒大球形顆粒，多數HBV-DNA陽性，三者消長基本呈平行關系。所以HBeAg陽性者具有很強的傳染性。HBeAb陽性者一般傳染性較低。但若血清HBV-DNA陽性，可能有HBV變異株存在，仍有一定的傳染性；
(3)HBeAg陽性提示HBV在體內復制。HBeAg消失前后出現HBeAb，此時期稱為血清轉換期，即由HBV復制期轉為非復制期。出現HBeAb常提示HBV增殖減弱或終止。但如果HBV基因的前C區核苷酸序列改變阻止了HBeAg的形成，血循環中仍有HBV存在，肝病可能繼續發展，并逐步演變成肝硬化；
(4)在出現原發性肝癌時，HBeAg檢出率下降，而HBeAb陽性,甲胎蛋白增高.故在HBsAg陽性的肝硬化病人中，HBeAb陽性，甲胎蛋白增高，提示早期肝癌的可能；
(5)母嬰傳播中，孕婦分娩時HBeAg陽性可能擴大母嬰之間的傳播率。
HBeAb臨床意義為：
（1）急性感染。最后可以表現抗-HBs,抗-HBe和抗-HBc都是陽性，標志著乙肝處于恢復期。
（2）與HBsAg、HBeAb同時出現的慢性持續性感染，即是乙肝小三陽。
（3）少數HBeAb 并伴有其它抗體陽性者，HBV-DNA仍為陽性,具有一定傳染性.
（4）HBeAb陽轉陰后仍有可能逆轉為HBeAg陽性；或注射乙肝疫苗成功后僅表現HBsAb 陽性,不會同時伴有HBeAb陽性。