二氧化氯水產養殖藥劑可用于治療魚、蝦、蟹、甲魚、蛙類等細菌性、病毒性疾病。對鯉、草、鰻、羅非魚等的赤皮、爛腮、出血性敗血病、腸炎、爛尾、水霉病等；蝦類病毒病、黑鰓、白毛病、打印病等；蟹類爛腮、水腫、腸炎、上岸癥、顫抖等；甲魚腐皮病、紅、白底板病、出血病、穿孔病等；蛙類的皮膚病、眼病等病害具有獨特功效，并能去除水中異味，改善水質，增加水體含氧量。
