4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示，circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能
發表期刊：Aging-us
影響因子：4.831
發表時間：2020.9.10
研究方法：全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供
文章鏈接：Profiling of circular RNAs in age-related cataract reveals circZNF292 as an antioxidant by sponging miR-23b-3p
老年性白內障(ARC)是世界范圍內造成視力損害和可逆性失明的主要原因之一。越來越多的證據表明circRNAs參與多種眼病的調控過程。然而，circRNA在ARC中的表達譜、調控作用和潛在機制仍不清楚。本文中作者對正常和弧形透鏡的晶狀體進行了全轉錄組測序，檢測到23787個候選circRNA。其中，有466個circRNAs具有顯著差異表達，并且在ARC和糖尿病白內障中，表達下調的circRNAs與表達上調的circRNAs相關性更高。隨后的生物信息學分析發現，某些差異表達的circRNA參與了ARC中的氧化應激和凋亡相關信號通路。其中，ARC中circZNF292水平顯著降低，而miR-23b-3p水平顯著升高。靶區預測和雙熒光素酶報告基因檢測證實circZNF292作為一種競爭性內源性RNA，通過與miR-23b-3p競爭調節抗氧化基因的表達。本文的研究結果表明，ARC患者晶狀體前囊中下調的circZNF292可能通過浸潤miR-23b-3p參與抗氧化損傷和晶狀體上皮細胞凋亡，為ARC的預防和治療提供了潛在靶點。
圖例：本研究的基本原理圖
分類三|外泌體+環狀RNA研究
5.血清外泌體circRNA的RNA-Seq分析顯示Circ-PNN是人類結直腸癌的潛在生物標志物
發表期刊：Frontiers in Oncology
影響因子：4.85
發表時間：2020.6.18
研究方法：全轉錄組測序、qRT-PCR等云序提供
文章鏈接：RNA-Seq Profiling of Serum Exosomal Circular RNAs Reveals Circ-PNN as a Potential Biomarker for Human Colorectal Cancer
環狀RNA
(circRNAs)正在成為非編碼RNA領域的主要研究熱點。越來越多的證據表明，外泌體circRNA可以作為檢測各種癌癥的潛在生物標志物。然而，大多數血清外泌體circRNA在結直腸癌(CRC)中的臨床重要性卻很少被研究。在本研究中，作者研究了血清外泌體circRNA在CRC診斷中的可能臨床應用。首先，作者對CRC血清樣本和健康對照血清樣本進行了全轉錄組測序分析，鑒定出與CRC相關的環狀RNA。測序數據顯示，CRC患者中有122個差異表達的circRNA，其中100個表達上調，22個表達下調。然后，通過RT-qPCR篩選出8個表達異常的circRNA進行驗證。驗證分析顯示，CRC患者血清外體circ-PNN
(hsa_circ_0101802)水平較健康對照組顯著上調。通過ROC分析發現circ-PNN在CRC診斷中具有顯著價值。最后，作者構建了基于circ-PNN的網絡圖，以確定其潛在的miRNA-mRNAs結合。并證實了CRC患者中hsa-miR-6833-3P、hsa-let-7i-3p、hsa-miR-1301-3P的表達與circ-PNN呈負相關。綜上所述，該項結果表明，血清外泌體circ-PNN可能是CRC檢測的一種潛在的非侵入性生物標志物，可能在CRC的發病機制中發揮關鍵作用。
圖例：人血清外泌體環狀RNA表達譜分析
6.在多囊卵巢綜合征中，卵泡液中缺失外泌體環狀lr可降低miR-1294的功能并抑制通過CYP19A1產生雌二醇
發表期刊：Aging-us
影響因子：4.831
發表時間：2020.7.10
研究方法：全轉錄組測序、qRT-PCR、雙熒光素酶實驗等云序提供
文章鏈接：Depletion
of exosomal circLDLR in follicle fluid derepresses miR-1294 function
and inhibits estradiol production via CYP19A1 in polycystic ovary
syndrome
多囊卵巢綜合征(PCOS)是生殖女性常見的內分泌代謝紊亂病癥，以多囊卵巢、高雄激素和慢性無排卵為特征。卵泡發育異常被認為是多囊卵巢綜合征的共同特征。本研究中鑒定了從PCOS患者濾泡液(FF)中分離的外泌體中circRNA的表達譜，從而研究了作為濾泡微環境中重要介質的外泌體circRNA在PCOS病因學和病理生物學中的分子功能。通過全轉錄組測序，作者比較了PCOS患者和對照組FF外泌體的circRNA表達譜，發現有16個circRNA表達明顯不同。GO和KEGG通路分析表明，它們的來源基因在PCOS相關通路中富集，包括卵巢甾體生成、醛固酮合成和分泌以及Jak-STAT信號通路。在16個差異表達的circRNA中，hsa_circ_0006877
(circLDLR)是由其來源基因LDLR(低密度脂蛋白受體)轉錄本加工而成，該轉錄本參與了卵巢的類固醇生成。通過qRT-PCR中進一步驗證了PCOS
FF外泌體的缺失。cytoscape軟件預測了circLDLR-miR-1294-CYP19A1競爭性內源性RNA
(ceRNA)網絡，并通過熒光素酶檢測進行證實。在機制上，KGN細胞中功能性circLDLR的細胞間轉移和消退實驗表明，在受體細胞中，減少外泌體中的circLDLR可以增加miR-1294的表達，抑制CYP19A1的表達，并降低雌激素(E2)的分泌。該發現揭示了circLDLR的ceRNA網絡，并為多囊卵巢綜合征中卵泡發育異常提供了新的信息。
圖例：差異表達circRNA分析