質量分析器是依據不同方式將離子源中生成的樣品離子按質荷比m/z的大小分開的儀器，是質譜儀的重要組成部件，位于離子源和檢測器之間。質量分析儀器主要包括單聚焦質量分析器、雙聚焦質量分析器 、四極桿質量分析器 、離子阱質量分析器、傅立葉變換離子回旋共振（FT-ICR） 以及飛行時間質量分析器（TOF）。詞條對上述質量分析儀進行了詳細介紹。
