PCR熔解曲線分析法是做realtime-pcr時分析，用來確定不同的反應產物，包括非特異性產物的分析方法。原理是在擴增反應完成后，通過逐漸增加溫度的同時監測每一步的熒光信號來產生溶解曲線，隨著反應中雙鏈DNA變性，熒光染料又回復到游離狀態導致熒光信號降低，用熒光信號改變的負的一次導數與溫度作圖，在擴增產物的溶解溫度上有一特征峰（Tm，DNA雙鏈解鏈50％的溫度），因為它們在不同的溫度溶解，所以用這個特征峰就可以將特異產物與其它產物如引物二聚體區分開。
