① DNA雙鏈損傷后,MRN識別斷點啟動修復,招募核酸內切酶分別在斷裂點上下游剪切形成突出的一段單鏈DNA,ATM、PPP2R2A、CHK2等參與;
② 復制蛋白A(RPA)結合到突出的單鏈DNA,形成停滯的復制叉;
③ BRCA1-BARD1二聚體,CtIP、CDK12、FANCL、H2AX等參與,識別并結合RPA所在的單鏈DNA;
④ RAD51-BRCA2-PALB2復合體形成,BRIP1、CHK1、RAD54L、ATR等參與,BRCA1-BARD1二聚體招募BRCA2復合體到單鏈DNA;
⑤ BRCA2帶來的RAD51取代RPA;
⑥ RAD51招募RAD51類同源復合體BCDX2和CX3,啟動同源重組修復。
如果此時HRR重要基因發生突變,注意,是重要基因發生突變,那么就會導至HRD的產生了。比如,根據AZ奧拉帕利在mCRPC中的伴隨診斷(F1CDx)來看呢,包含了15個HRR基因,其中PPP2R2A基因突變對PARP抑制劑不敏感,所以有效的HRR基因僅有14個,這個PPP2R2A基因就可能不是HRR重要基因。
卵巢癌中PARPi的靶向治療需要檢測BRCA和HRD,HRD已經獲FDA批準作為奧拉帕利+貝伐一線維持治療的生物標志物。
從BRCA到HRD的檢測,是從因到果的檢測策略轉變,HRD的表象就是基因組疤痕(LOH、TAI及LST,非造成HRD的機制,比如HRD可以導至染色體末端連接異常,導至TAI的情況;HRD導至LST的畸變;HRD導至單親二體或LOH),LOH是通過SNP探針覆蓋全基因組來檢測的,3萬?5萬?看自己選且有講究。
HRD檢測規范:FoundationFocus CDx BRCA LOH Assay:FDA批準作為補充診斷(卡值16);Myriad Genetics myChoice HRD:FDA批準作為伴隨診斷(卡值42);
BRCA檢測,已經非常成熟,但是需要注意的還是大片段重排(缺失),比如某上市的BRCA-NGS檢測產品,開始是不能檢測大片段缺失的,后來升級后可以檢測了(CNV),通過MLPA驗證后確實是大片段缺失,這也證明了BRCA大片段缺失檢測的重要性(NGS檢測BRCA必須能檢測大片段缺失才不容易漏檢!)。
中山大學孫逸仙紀念醫院細胞分子診斷中心,在2019年年末就開始進行HRD的研究性檢測,不得不說這個訊息捕獲確實是厲害(2019年10月FDA批準HRD作為尼拉帕利三線及以上維持治療的生物標志物),比市面上的基因檢測公司布局HRD產品研發早半年到一年時間(現在還有公司尚未布局HRD檢測產品研發;2020年5月FDA批準HRD作為奧拉帕利+貝伐一線維持治療的生物標志物)。
其次,這個報告中的“科研”兩個字很有靈性,科學、嚴謹又規范(“遵紀守法”的楷模),該HRD科研報告中,HRD-GS的cut-off值是53,說明是經過臨床的嚴格驗證得出的閾值,而不是直接套用Myriad myChoice的42(或33)閾值,值得市場基因檢測公司的學習(有多少在套用42閾值呢,站出來解(狡)釋(辯)一下)。