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  • 發布時間:2016-10-26 10:12 原文鏈接: 眾包個體基因數據庫緩慢發展

    Yaniv Erlich

      計算遺傳學家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家譜”而引人注目。而目前,他的DNA.land又引發新一輪個體基因數據庫“眾包熱潮”。

      早在2013 年,Erlich 團隊就發表了一篇論文,介紹了如何利用公共資源,通過交叉比對的方法確定遺傳學研究參與者的個人身份。

      之前研究發現,人們“遺留”在各個數據庫里的匿名遺傳學信息會泄露他們的真實身份信息,只需要將這些數據與個人的 DNA 進行一下比對就可以了。而且 Erlich 發現,只需要連上互聯網就足以完成這一切工作。之后,該研究組還將1300萬人的系譜信息結合到一棵家庭樹上。

      去年,Erlich與合作者、哥倫比亞大學的Joe Pickrell邀請在23andMe和Ancestry.com等商業基因公司測試過DNA的人,分享自己的DNA報告用于研究。Erlich提到,DNA.land將收入已經寄出唾液樣本進行檢測的300萬參與者的基因數據。

      與企業不同,DNA.land將取得參與者同意,將他們的個人信息向研究人員開放。本月,DNA.land已經有3.2萬注冊參與者。Erlich近日在美國人類遺傳學年會上報告了自己的成果,并表示,盡管不足100萬人,但他仍認為該項目走上了正軌且進入了新領地。

      “與其他試圖眾包DNA或人體材料的項目相比,我認為我們已經取得了很多成功。你需要花時間建立動量。”Erlich說。而目前,DNA.land的資料已經被用于研究,他的團隊已經發表了一篇基于MinION 測序的bioRxiv論文。“我們使用DNA.land作為掃描大群體的方法,以判斷能否確定單獨的個體,像我或Joe。”Erlich說。

      下一步,Erlich計劃探索能否眾包人們的臉書網檔案。通常,獲得外表型(例如性格等)更困難。在一篇發表于美國《國家科學院院刊》上的研究中,研究人員基于你的喜好,就能獲得你的5大人格特性。

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