(1)大腸桿菌
革蘭氏陰性菌
受體細胞培養
a.基因組、遺傳背景了解最清楚
b.易培養、繁殖迅速
(2)枯草桿菌
革蘭氏陽性菌
a.具胞外酶分泌-調節基因，能將表達產物
分泌到培養基；
b.無內毒素；
c.易于保存與培養。 (3)藍細菌
a.光能自養型，易于培養；
b.與植物密碼子和啟動子的通用性，
易于表達植物基因
以微生物（主要有大腸桿菌、枯草桿菌和酵母菌）為受體細胞的基因工程在技術上最為成熟，在生物制藥中也得到廣泛的應用。大腸桿菌雖然是條件致病菌，但是通過人工改造，可以使它成為一個很安全的宿主菌。