有嗜睡、手抖、食欲減退、惡心、嘔吐等不良反應。出現意識障礙、肝功能異常、胰腺炎等嚴重副反應時，應停藥。停藥時應逐漸減量以防再次出現發作；取代其他抗驚厥藥物時，丙戊酰胺應逐漸增加用量，而被取代藥應逐漸減少用量。長期用藥不宜突然停藥。肛門給藥時，用藥前需排空大便。
