甲磺酸帕珠沙星分散片的國內外臨床試驗中常見的不良反應為惡心、陰道炎、腹瀉、頭痛、眩暈。發生率較低的藥物相關不良事件包括：
1、全身反應：變態反應，寒戰，發熱，背痛和胸痛。
2、心血管系統：心悸。
3、消化系統：腹痛、便秘，消化不良、舌炎、念珠菌性口腔炎，口腔炎，口腔潰瘍，嘔吐。
4、代謝與營養系統：周圍性水腫。
5、神經系統：多夢，失眠，感覺異常，震顫，血管擴張，眩暈。
6、呼吸系統：呼吸困難，咽炎。
7、皮膚及皮膚軟組織：皮疹，出汗。
8、特殊感官：視覺異常，味覺異常，耳鳴。
9、泌尿生殖系統：排尿困難，血尿。
10、其它罕見的相關不良事件有：思維異常，煩躁不安，不能耐受酒精，食欲不振，焦慮，關節痛，關節炎，虛弱，哮喘（支氣管痙攣），共濟失調，骨痛，心動過緩，乳腺痛，唇炎，結腸炎，意識模糊，驚厥，紫紺，人格解體，抑郁，糖尿病，皮膚干燥，吞咽困難，耳病，瘀斑，水腫，鼻衄，欣快感，眼痛，面部水腫，胃腸脹氣，胃炎，胃腸出血，牙齦炎，口臭，幻覺，嘔血，敵意，感覺過敏，高血糖，高血壓，肌張力增加，過度通氣，低血糖，下肢痛性痙攣，淋巴結病，斑丘疹，子宮出血，偏頭痛，嘴部水腫，肌痛，肌無力，頸痛，神經過敏，驚慌，妄想狂，嗅覺倒錯，瘙癢，偽膜性腸炎，精神病，上臉下垂，直腸出血，嗜睡，緊張，胸骨下胸痛，心動過速，味覺喪失，口干，舌腫，皰疹等。
11、實驗室檢查異常改變發生率低，包括：白細胞減少，ALT或AST增高以及堿性磷酸酶，總膽紅素，血清淀粉酶，電解質異常等。