本藥不良反應與給藥劑量相關，發生率較高且較為嚴重，部分患者在用藥18個月內因無法耐受而停藥。最初的不良反應多為胃腸道功能紊亂、味覺減退、中等程度的血小板計數減少，但嚴重者不多見。長期大劑量服用，皮膚膠原和彈性蛋白受損，導致皮膚脆性 增加，有時出現穿孔性組織瘤和皮膚松馳。大多數不良反應可在停藥后自行緩解和消失。
1、過敏反應 可出現全身瘙癢、皮疹、蕁麻疹、發熱、關節疼痛和淋巴結腫大等過敏反應。重者可發生狼瘡樣紅斑和剝脫性皮炎。
2、消化系統 可有惡心、嘔吐、食欲減退、腹痛、腹瀉、味覺減退、口腔潰瘍、舌炎、牙齦炎及潰瘍病復發等。少數患者出現肝功異常(氨基轉移酶升高)。
3、泌尿生殖系統 部分患者出現蛋白尿，少數患者可出現腎病綜合征。用藥6個月后，有的患者出現嚴重的腎病綜合征。
4、血液 可導致骨髓抑制，主要表現為血小板和白細胞減少、粒細胞缺乏，嚴重者可出現再生障礙性貧血。也可見嗜酸粒細胞增多、溶血性貧血。
5、神經系統 可有眼瞼下垂、斜視、動眼神經麻痹等。少數患者在用藥初期可出現周圍神經病變。長期服用可引起視神經炎。治療肝豆狀核變性時，易加重神經系統癥狀，可導致痙攣、肌肉攣縮、昏迷甚至死亡。
6、代謝/內分泌系統 本藥可與多種金屬形成復合物，可能導致銅、鐵、鋅或其他微量元素的缺乏。
7、呼吸系統 可能加重或誘發哮喘發作。
8、其他 本藥可使皮膚變脆和出血，并影響創口愈合。據報道，本藥尚可導致狼瘡樣綜合征、重癥肌無力、Goodpasture綜合征、多發性肌炎、耳鳴。也可導致IgA檢驗值降低。