許多年以來，傅立葉變換離子回旋共振質譜（Fourier-transform ion-cyclotron resonance mass spectrometry, FT-ICR-MS）在氣相離子-分子反應的基礎研究中成為有效的手段。該質譜與ESI 離子源聯接后被廣泛地應用于 生物大分子的研究，能夠充分發揮其高分辨率和準確度的優勢。基于傅立葉變換離子回旋共振池內離子的四極激發，該質譜可以選擇地累積非 共價鍵復雜化合物的離子，使其能夠分析分子量非常大的生物大分子化合物，如分析分子量高達108Da 的大腸桿菌 噬菌體的T4 DNA，成為該 質譜儀發展的重要里程碑。該質譜儀通過 射頻脈沖消除其它離子的干擾選擇性地捕獲目標離子到離子回旋共振池內，也能夠進行多級質譜分析。當前又有許多新的離子裂解方法應用到 傅立葉變換離子回旋共振質譜儀，如碰撞誘導裂解、激光致光裂解或紅外多光子光裂解、表面誘導裂解、黑體 紅外輻射裂解、 電子捕獲裂解等，又進一步改善了這種質譜儀分析的性能。
除上面描述的常見的幾種 接口技術和質譜儀之外，還有其它的一些產品不斷問世。近十年來，人們在液-質聯用技術的研究方面已經將研究的重點轉移到研制適合某種分析領域的強優勢的技術，并加速產品的商業化。總之，液-質聯用分析技術的發展取決于液-質聯用接口技術和質譜分析儀技術的共同發展。通過合適的接口將液相色譜與質譜儀聯接，會獲得具有特殊分析性能的液-質聯用儀器，另外通過接口將質譜與質譜進行串聯，可以彌補各種質譜儀的不足，達到取長補短，協同提高的效果。