伊曲康唑對兒科患者的有效性和安全性尚未確定。膠囊和注射液沒有針對兒童的藥代動力學數據。
伊曲康唑對兒童骨增長的長期影響尚不明確。在三項大鼠毒性試驗中，伊曲康唑在20 mg/kg/天（2.5 × MRHD）劑量水平時即可誘導骨缺陷。誘導缺陷包括降低骨板活性，大骨致密層變薄和增加骨脆性。80 mg/kg/天（10 × MRHD）用藥一年以上，或160 mg/kg/天（20 × MRHD）用藥6個月，伊曲康唑在某些大鼠中可誘導小牙髓細胞減少表現。在成年患者中沒有報告此類骨毒性。
