主要引起兩大類癥狀即：壓迫癥狀和感染癥狀。
1.壓迫癥狀
壓迫支氣管可出現干咳、氣急、呼吸困難等。如為張力性囊腫，可因囊腫快速、極度的膨脹，出現類似張力性 氣胸的癥狀。壓迫食管可致梗噎。而在小兒，巨大的囊腫可能壓迫循環系統，造成極度呼吸困難和發紺。囊腫感染及囊內出血可使囊腫短期內迅速增大，并伴有壓迫及疼痛等癥狀。
2.感染癥狀
囊腫感染多因其與支氣管相通所致。可出現咳嗽、咳痰、 咯血、發熱等，嚴重者，可出現高熱、寒戰、排大量膿痰。
3.X線表現
透視可見囊腫隨呼吸運動改變其大小。此癥在肺內表現為圓形或類圓形陰影，邊緣清晰銳利，在與支氣管相通之前，表現為較高密度且均勻的影像，如與支氣管相通且氣體進入囊腫后，出現氣液平及單腔或多腔表現。如囊腫感染，其邊緣不清，周圍組織 肺炎癥表現。先天性 支氣管源性囊腫常見于兒童病例，囊腫位于肺間質或縱隔 內。約70%位于肺內，30%位于縱隔。由于囊腫可為單個或多個，含氣體或液體量不同，因而在X線胸片上可呈現不同表現。