植物葉片是植物進行光合作用的重要器官，而葉綠素的多少直接影響光合速率的快慢，在一定的范圍內，葉綠素含量越多，光合速率越強。因此光合儀的測量對象一般也是針對于植物的葉片的，因此在對葉片的選擇上，應該盡量選擇有代表的葉片。由于植物葉子呈現顏色是葉子各種色素的綜合表現，主要是有綠色的葉綠素和黃色的類胡蘿卜素兩色素之間的比例決定的，因此如果測試區大部分是黃頁，那么就應該選擇黃頁，而此區大多是綠葉，則應該選綠葉。另外葉片的伸展、蜷縮、有無病蟲害以及葉片的寬窄等也會直接或間接影響光合速率，因此在選擇測試葉片的時候，也需要充分考慮這一點。
光合儀測定的凈光合速率和蒸騰速率是單位葉面積下的測量值，因此確定測量面積也是測定過程中重要的一步，應該根據植物葉片的大小選擇所使用的葉室，只要是葉片的面積大于葉室的測量面積，那么就可以保證葉室被葉片完全充滿，這種情況下就不需要改變面積參數了。
總之在使用光合儀測定植物光合速率的過程中，對于測試葉片的選擇是非常關鍵，如果選擇的不合適，就很難真實反映植物的光合速率，因此，應該選擇哪些有代表性的葉片，同時植株也應該選擇能夠代表大多數葉片的植株，可以才葉片的顏色、狀態等多個角度進行選擇