在光合作用的光反應中,除了將一部分光能轉移到NADPH中暫時儲存外,還要利用另外一部分光能合成ATP,將光合作用與ADP的磷酸化偶聯起來,這一過程稱為光合磷酸化。它同線粒體的氧化磷酸化的主要區別是:氧化磷酸化是由高能化合物分子氧化驅動的,而光合磷酸化是由光子驅動的。