這個系統由免疫器官(骨髓、脾臟、淋巴結、扁桃體、小腸集合淋巴結、闌尾、胸腺等)、免疫細胞(淋巴細胞、單核吞噬細胞、中性粒細胞、嗜堿粒細胞、嗜酸粒細胞、肥大細胞、血小板(因為血小板里有IgG)等),以及免疫活性物質(抗體、溶菌酶、補體、免疫球蛋白、干擾素、白細胞介素、腫瘤壞死因子等細胞因子)組成。
免疫系統分為固有免疫(又稱非特異性免疫)和適應免疫(又稱特異性免疫),其中適應免疫又分為體液免疫和細胞免疫。