新冠肺炎疫情牽動著每一個人的心。全力做好肺炎疫情防控工作,是華大智造和社會各界的共同目標。面對這場沒有硝煙的戰爭,華大智造DNBSEQ系列高通量基因測序儀被用于基因組序列組裝,疑似患者檢測,變異檢測等肺炎防控關鍵時刻。
MGISEQ-2000成為最早發布新型冠狀病毒基因組測序儀之一
MGISEQ-2000作為中高通量測序儀,在臨床和科研上都廣泛使用,在全國各地本地化數據測序、助力分析新冠病毒基因組序列等發揮了重要作用。
MGISEQ-2000
12月30日,在最早一批提交至全球共享流感病毒數據庫GISAID發布的13例新型冠狀病毒基因組序列數據中,有5例數據來自華大智造高通量測序儀——MGISEQ-2000,這為研究分析武漢新型冠狀病毒的進化來源、致病病理機制提供了第一手資料。
基于MGISEQ-2000技術平臺提交的序列數據
1月23日,MGISEQ-2000在北京緊急檢測任務中發揮了至關重要的作用,接到任務后,快速進行建庫、上機,在1月25日凌晨3點成功下機。同一時間,在全球共享流感病毒數據庫GISAID數據庫中,已公開發布的新型冠狀病毒基因組序列已增加至26例【1】。
新型冠狀病毒2019-nCoV基因組結構示意圖(來源:Nextstrain)
1月25日,在深圳某醫院MGISEQ-2000配合臨床診療過程需要,參與溯源分析和研究。
1月27日,位于北京的MGISEQ-2000再次發揮了其全面靈活、質量穩定、測序速度快等優勢。作為核酸檢測試劑盒(PCR方法)的補充,對于部分病毒含量較低的樣本,基于MGISEQ-2000高通量測序儀進行測序,可以提高陽性檢出率,避免漏檢和錯檢;對于疑似感染、多重感染或繼發感染病原樣本,而基于DNBSEQ高通量測序儀進行測序,可以進行并發檢測,提供更多可能感染的病原信息。
華大智造高通量測序儀MGISEQ-2000在路上
超高通量測序儀DNBSEQ-T7成為規模化檢測重器
年末歲初,武漢,在中國科學院微生物研究所、山東第一醫科大學和華大基因的通力合作下,來自華大智造的DNBSEQ-T7出色完成基因組測序任務,快速完成該新型冠狀病毒組測序。
基于DNBSEQ-T7的4個樣本組裝文件
1月21日,緊急新增的DNBSEQ-T7測序儀連夜部署,最快可在20小時內對128個病例實現從樣本到下機報告的輸出,且每個樣本經高通量測序獲得的總Reads數超過100 Million reads,能有效提高病原微生物的檢測靈敏度。
領域應用專家在DNBSEQ-T7前進行上機操作
除此之外,1月22日,位于上海、廣州等地的DNBSEQ高通量測序儀——MGISEQ-200也完成數據更新,更新后的數據庫包含引新型冠狀病毒序列。
華大智造成立應急專項小組,開通技術支持專線
為了更好支持各地區測序儀的運作,華大智造成立應急專項小組、開通應急技術支持專線,24小時待命,共同助力疫情防控。在全國配備精銳力量,24小時待命,提供基于高通量測序方法的新型冠狀病毒應急方案,支持臨床鑒別提供診斷依據包括新型冠狀病毒在內的其他冠狀病毒和呼吸道病原感染,實現病毒序列快速檢測,并為監測可能存在的病毒變異提供支持。
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