丘疹的鑒別診斷主要是區別感染性炎癥性丘疹,非感染性炎性丘疹或腫瘤性的丘疹。感染性炎癥性丘疹中是病毒感染、細菌感染、螺旋體感染、真菌感染還是寄生蟲及昆蟲感染的丘疹；非感染性炎性丘疹中是變態反應性、丘疹鱗屬性皮膚病、神經因素、血管炎性皮膚病、物理因素還是皮脂腺分泌因素引起的丘疹。
