流感病毒的外層有兩種不同糖蛋白構成輻射狀突起，即血凝素（H）和神經氨酸酶（N）。流感病毒的抗原變異就是指H和N抗原結構的改變。乙型流感病毒的抗原變異很慢。如果H和N都發生了大的變異，便產生了新的亞型（質變），如1957年H2N2（甲2亞型）、1968年以后的H3N2（甲3亞型）。乙型流感病毒間同樣有變異，但未劃分成亞型轉變。
中國流行的有甲3和甲1兩個亞型毒株，乙型病毒中同時存在有兩個系抗原性和基因特性明顯不同的毒株。
乙型流感呈暴發或小流行，不引起世界性流感大流行。至今還未找到它存在于人之外的其他動物中的證據。