這種代表個體特異性的組織抗原稱組織相容性抗原，一套這樣的抗原系統稱主要組織相容性系統(majorhistocompatibilitysystem,MHS)。編碼MHS的基因群稱為主要組織相容性復合體MHC即指某一染色體上一群緊密連鎖的基因群。
人的MHC就稱HLA(humanleucocyteantigen)，HLA作為抗原研究時，稱HLA抗原系統；HLA作為基因研究時稱HLA復合體，它位于第6號染色體短臂上6p21.3，全長4000kb。它是為200個以上基因座位組成的基因復合體；是迄今已知基因中等位基因多態性最高的基因復合體；其多態性與疾病的遺傳易感性有明顯關系。HLA包括有I類II類和III類基因部分。
HLAI類和II類基因所表達的抗原位于細胞膜上，為MHC-I(A、B、C位點編碼)和MHC-II(D區編碼)，I類幾乎分布于身體全部細胞表面，II類主要是定位于巨噬細胞和B淋巴細胞表面的糖蛋白。