在文獻上，體積排除色譜的名稱曾很混亂，這是由于其發展歷史及所用分離材料的不同等因素所造成的。
1953年，Porath和Flodin首先用交聯葡聚糖凝膠在水溶液中分離水溶性高分子。這種交聯葡聚糖凝膠的商品名稱，即是后來廣為人們所知的Sephadex。由于其突出的優點，立即得到了生化界的承認和廣泛的應用。這種分離技術被稱為凝膠過濾(gel filltration chromatogr.)。
在水溶液體系中的成功，促使人們去研究非水有機溶劑體系中的凝膠色譜。1964年，Moore以苯乙烯一二乙烯苯共聚物為基質的不同孔徑的有機高分子凝膠，解決了分子量幾千至幾百萬的合成高分子的體積排除色譜分離問題。在分離高分子分級與分子量測定領域內，被稱之為凝膠滲透色譜(gel permeation chromatogr．)。1965年Waters公司的專用凝膠色譜儀問世(GPC 200)。以后的幾年中，從理論到儀器乃至應用等各個方面，凝膠色譜得到了快速發展并日臻完善，成為高效液相色譜家族中重要的一員。
關于名稱，20世紀70年代時曾統一為凝膠色譜(gel chromatography)。但是，體積排阻色譜這一名稱似乎能更確切地反映其分離過程的本質。因此，以稱其為體積排阻色譜為宜。不過，SEC主要的應用領域是生化分離和高分子科學，前者仍習慣地將其稱之為凝膠過濾色譜，而后者，更習慣地沿用凝膠滲透色譜的名稱。