此類化合物大多不符合C6-C3-C6的基本骨架，但因具有苯并γ-吡喃酮結構，我們也將其歸為黃酮類化合物。雙黃酮類是由二分子黃酮衍生物通過C-C鍵或C-O-C鍵聚合而成的二聚物。如銀杏葉中含有的銀杏素即為C-C鍵相結合的雙黃酮衍生物。
高異黃酮：和異黃酮相比，其B環和C環之間多了一個-CH2-，如中藥麥冬中存在的麥冬高異黃酮A（ophiopogonone A）。
呋喃色原酮：即色原酮的C6-C7位并上一個呋喃環。如凱刺種子和果實中得到的凱林屬于此類。
苯色原酮：即色原酮的C6-C7位并上一個苯環。如決明子中含有的紅鐮酶素屬于此類。