1.體格檢查
肛門直腸檢查可發現肛門括約肌松弛或出現不協調性收縮。
2.實驗室檢查
（1）血常規：白細胞計數和中性粒細胞比例增高。。
（2）便常規：應注意檢查糞便性狀、紅細胞和白細胞、寄生蟲（卵）、脂肪滴等，以判斷有無消化道出血、細菌或寄生蟲感染及消化不良等疾病。
（3）血氣分析及水電解質檢查：長期腹瀉的患者可能會有酸堿失衡及水電解質紊亂。
3.影像學檢查
（1）內鏡檢查：①肛管超聲內鏡檢查，可檢測出括約肌變薄或缺損；②乙狀結腸鏡或全結腸鏡檢查，以確定是否存在器質性病變；③通過觀察消化道黏膜，判斷有無炎癥病變。
（2）盆底磁共振：能夠實時顯示肛門括約肌解剖和整體盆底運動，同時也可觀察膀胱和生殖器的情況。
（3）排糞造影：在評價排便功能的同時可顯示合并存在的直腸和盆底形態結構異常。磁共振排糞造影較傳統的X線排糞造影更加清晰的顯示盆底軟組織改變。
（4）肌電圖：能敏感檢測出去神經病變，常能鑒別肌源性、神經源性或混合性損傷。
4.特殊檢查
（1）肛管壓力測量：患者靜息時測定的壓力可反映肛門內括約肌功能，正常壓為80～140 mmHg，肛門失禁時壓力降低，肛門外括約肌收縮時可使肛管內壓提高。
（2）球囊逼出試驗：是評估排便功能的篩選檢查，但是不能明確排便障礙的機制。
