肥胖癥患者的實驗室檢查主要是除外繼發于其他疾病的繼發性肥胖癥和對肥胖相關疾病的檢查。通過皮質醇節律結合小劑量地塞米松抑制試驗可以除外庫欣綜合征，而甲狀腺功能檢查有助于除外甲狀腺功能減退癥。MRI有助于發現由于下丘腦攝食中樞病變導致的肥胖癥。3小時葡萄糖耐量試驗有助于判斷肥胖患者糖耐量狀態，血脂、肝腎功能、性腺軸功能、呼吸睡眠監測、心功能評價、肝臟和血管彩超有助于篩查肥胖癥患者相關的并發癥如脂肪肝、呼吸睡眠暫停低通氣綜合征和動脈粥樣硬化等。
