彩色多普勒超聲、MRI、CT、血清腫瘤標記物等，以及個別特殊情況下應用腹腔穿刺、腹腔鏡檢查、剖腹探查等。
1、超聲檢查
超聲是檢查卵巢囊腫最簡便的檢查方法。超聲檢查可以顯示患側卵巢腫大，有觸痛。
2、腹腔鏡檢查
可直接看到腫物的大體情況，可觀察整個盆腹腔，在可疑部位進行多點活檢并吸收腹液進行細胞學檢查可確定診斷及術后監護。但對巨大腫塊或粘連性腫塊患者禁忌施行，也無法觀察到腹膜后淋巴結。
3、放射學診斷
MRI、CT等對腫瘤肝、肺及腹膜后淋巴結等轉移診斷有幫助。腹平片有助于腸梗阻的診斷。
4、其他
若囊腫為惡性的卵巢腫瘤，和其他腫瘤一樣，能制造和釋放抗原，激素及酶等多種產物，這些物質在患者血清中可通過免疫學，生化等方法測出，稱為腫瘤標志物，提示體內存在某種腫瘤。
（1）抗原標志物CA125是卵巢腫物較敏感的腫瘤標記物。AFP是內胚竇瘤的最好腫瘤標志。未成熟畸胎瘤AFP值也可升高，AFP的升高常先于臨床體征，它在診斷和監護方面都具有重要意義。
（2）激素標志物絨毛膜促性腺激素β亞單位（β-hCG）是妊娠滋養細胞疾病特異性很高的標志物，卵巢絨癌患者血清濃度也往往升高。顆粒細胞瘤及卵泡膜細胞瘤患者雌激素水平上升。30%的睪丸母細胞瘤患者尿17-酮類固醇的排出量增高。
（3）酶的標志物/乳酸脫氫酶（LDH）在卵巢惡性腫瘤患者的排出量增高。