卵巢巧克力囊腫是子宮內膜異位癥的一種類型。其中，卵巢巧克力囊腫又占80%左右。卵巢巧克力囊腫病變可只累及一側卵巢，但約有50%以上的患者會累及雙側卵巢。隨著病情的發展，患者可出現痛經、持續性下腹疼痛、月經失調、不孕和性交痛等病癥。
