所謂基體效應,是指樣品的化學組成和物理、化學狀態的變化對待測元素的特征X熒光強度所造成的影響,大致可分為元素間吸收增強效應和物理、化學效應。元素間吸收增強效應與樣品組成和儀器參數有關;物理效應主要表現在樣品顆粒度、不均勻性造成的影響;化學效應主要表現在樣品的礦物效應,即不同礦物形態對特征X熒光強度產生的影響。