基因沉寂（Gene Silencing) 也可以被稱為“基因沉默”。基因沉寂是真核生物細胞基因表達調節的一種重要手段。指的是真核生物中由雙鏈RNA誘導的識別和清除細胞非正常RNA的一種機制。以前，“基因沉寂”被理解為是真核生物染色體形成異染色質（Heterochromatin)的過程。最近的研究表明，“基因沉寂” 與“異染色質” 存在差異，盡管被沉寂的基因區段也呈高濃縮狀態，但“基因沉寂” 所形成的染色體構象并不完全等同于"異染色質“構象。除此之外，兩者還存在著基因表達調控程度上的差異，一般認為處于"基因沉寂“ 的染色質區的基因表達被”徹底“關閉，而”異染色質“ 狀態的基因可能依然進行低水平的表達（轉錄）。