多重肺部感染的病原譜可以是任何不同類型病原體或同一類型中不同種(屬)病原體的同時感染，比較常見的病原體組合為：
1.復數細菌感染
兩種或多種需氧菌(包括革蘭陽性和革蘭陰性、兩種革蘭陰性桿菌或兩種革蘭陽性球菌)、需氧菌與厭氧菌、分枝桿菌與普通細菌合并感染。
2.細菌加真菌感染
任何細菌和真菌合并感染，以需氧菌與條件致病菌如念珠菌、曲霉菌最常見。3.細菌加原蟲感染以卡氏肺孢子蟲合并細菌感染為常見。
4.細菌加病毒感染
常見呼吸道病毒感染繼發細菌感染。在免疫抑制患者常見有細菌與巨細胞病毒的合并感染。
