1、安非他酮不可與其它含有鹽酸安非他酮的藥物聯合使用。
2、癲癇。
安非他酮的推薦劑量為不超過300mg/d，450～600mg/d的癲癇發生率會增長近十倍。可見癲癇的發生與劑量有明顯的相關性。突然給藥或增大劑量均會增加癲癇的發生，可在治療過程中發生，也可在獲得穩定劑量后的幾周后出現。此外，許多因素均可導致癲癇發作的可能性增加，因此應用安非他酮時還應考慮到個體因素、臨床情況以及協同用藥等情況。
個體因素：由于個體差異，對安非他酮代謝和消除的能力也不同，這些都會增加癲癇的發生率。腦外傷、間歇性癲癇、中樞神經系統腫瘤、重度肝硬化等可降低癲癇閾值而誘發癲癇。
臨床情況：周圍環境可導致癲癇發生；濫用酒精，應用酒精和鎮靜藥的過程中突然停用鴉片、可卡因或者其他成癮性藥物，過多使用刺激性藥物或安眠藥，口服降糖藥或胰島素治療高血壓。
協同用藥：目前一些藥物和治療方法可降低閾值增加癲癇發生率，如：其他抗抑郁藥，鎮靜藥，茶堿類藥，以及類固醇系列藥物等或者在治療中對苯丙二氮卓類藥物突然停藥。
降低癲癇發病率的建議：根據安非他酮的研究進展，回顧臨床應用情況，以下措施可以降低癲癇的發生：
每日安非他酮總量≤450mg/d；分三次服用，每次劑量≤150mg/d，避免安非他酮和/或代謝產物血藥濃度達到高峰；用藥量逐步增加。
安非他酮應慎用于有癲癇病史、腦外傷患者以及其他一些癲癇易發體質的患者；在與其他藥物（如安定、抗抑郁藥、茶堿類、類固醇類藥物等）配伍使用時應慎重；在某些治療方式下（如突然停用苯二氮卓類藥物）應慎用，這些都會減低癲癇發作的閾值。
3、易怒和失眠。服用安非他酮的部分患者會出現躁動不安、易怒、焦慮和失眠，特別是開始治療后不久。臨床研究中，這些癥狀有時需要鎮定藥/催眠藥治療。2%的患者癥狀嚴重到需要停用安非他酮。
4、目前沒有安非他酮對心肌損傷或心臟疾病的患者安全用量的臨床經驗，因此，這群患者應慎用。有體位性低血壓病史，正在接受三環類抗抑郁藥治療的抑郁癥患者能很好的耐受安非他酮。36例充血性心衰的住院病人也是如此。但是，安非他酮會導致充血性心衰患者仰臥位血壓升高，2例患者因遠高于基線血壓而出組。
5、肝損壞的患者慎用。重度肝硬化的患者應用安非他酮時應極其謹慎，要減少藥量和用藥次數，這部分患者服用本品時，最大劑量不超過75mg，每日服用一次。輕中度肝硬化的患者也需減少用藥次數和/或藥量。
對所有肝臟損傷的患者密切監測反映安非他酮及其代謝物水平的不良反應。
6、腎功能障礙患者慎用。目前尚無腎損傷的報道。安非他酮代謝廣泛，在肝臟轉換成其活性代謝產物，再在腎臟進一步代謝并排除體外。腎損傷的患者應慎用安非他酮，要減少用藥次數和/或藥量，因此這群患者的安非他酮及其代謝物較健康者更易蓄積。應密切監測反映安非他酮及其代謝物水平的不良反應。
7、本品有導致過敏反應的可能性。安非他酮臨床試驗過程中有報道出現需要治療的類過敏/過敏反應，如皮膚瘙癢、蕁麻疹、血管性水腫、呼吸困難。另外，在售后監測期有安非他酮致的紅斑狼瘡、Stevens－Johnson綜合癥和過敏性休克的報道。有過敏史，或者出現類過敏/過敏反應癥狀（如皮疹、瘙癢、蕁麻疹、胸痛、水腫、呼吸短促）的患者應停用安非他酮，并咨詢醫生。
有報道安非他酮致的遲發性過敏反應（關節痛、肌痛、發熱伴皮疹和其他癥狀）。這些癥狀與血清病極為相似。
8、精神病、精神錯亂和其他神經精神癥狀：服用安非他酮的患者據報道引發的精神現象比較普遍，如幻覺、錯覺、精神注意力難以集中、偏執和精神混亂等。減少藥量或停藥，以上現象會減輕，甚至消失。
9、自殺，抑郁癥患者本身就會出現自殺企圖，并可能持續到明顯緩解為止。安非他酮應從最小劑量開始服用。