1.急性或亞急性起病，常伴發熱，部分患兒有呼吸道或消化道癥狀。
2.有不同程度的意識障礙，輕者僅表現為淡漠、嗜睡，重者有神志不清、譫妄、昏迷。較大兒童可出現精神異常，情緒障礙等。
3.顱內高壓征：頭痛、頭暈、嘔吐、肌脹力增高，小嬰兒表現為前囟緊張或隆起，嚴重的顱內高壓可致腦疝，出現呼吸回圈衰竭。
4.腦實質的損害可導致全身性或局限性的抽搐，因病變部位的不同而表現為偏癱、單癱或雙側癱。亦可見顱神經損害征、共濟失調、不自主動作等，多數病兒肌張力增高，腱反射亢進，常有病理神經反射，病變若波及腦膜，可出現腦膜刺激征。
