汞蒸汽較易透過肺泡壁含脂質的細胞膜，與血液中的脂質結合，很快分布到全身各組織。汞在紅細胞和其他組織中被氧化成Hg，并與蛋白質結合而蓄積，很難再被釋放。金屬汞在胃腸道幾乎不吸收，僅吸收約攝食量的萬分之一，汞鹽在消化道的吸收量約10%。汞主要由尿和糞中排出，唾液、乳汁、汗液亦有少量排泄，肺部呼出甚微。體內汞元素半周期為60天，汞鹽約40天，在最初4天內排泄量較多。汞離子易與巰基結合，使與巰基有關的細胞色素氧化酶、丙酮酸激酶、琥珀酸脫氫酶等失去活性。近年來，發現汞對腎臟損害以腎近曲小管上皮細胞為主。汞還可引起免疫功能紊亂，產生自身抗體，發生腎病綜合征或腎小球腎炎。