本病的病原以金黃色葡萄球菌、厭氧菌感染最多見,其次為肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、溶血性鏈球菌、克雷白桿菌大腸埃希桿菌、銅綠假單胞菌等。往往與厭氧菌混合感染。肺膿腫多繼發于肺炎,其次為敗血癥,少數患者可由鄰近組織化膿性病灶,如肝膿腫、膈下膿腫或膿胸蔓延至肺部氣道異物繼發感染,細菌污染的分泌物、嘔吐物在某種情況下被吸入下呼吸道,及肺吸蟲、蛔蟲及肺胸膜阿米巴所引起。吸入性肺膿腫多見于年長兒,血源性肺膿腫繼發性肺膿腫多見于嬰幼兒。肺膿腫形成三個要素:細菌感染、支氣管堵塞和機體抗感染能力低下。致病細菌或原蟲破壞肺實質,一般過程包括炎癥期、化膿期和膿腫形成期。