1.實驗室檢查
小腸炎性疾病的患者白細胞計數均有不同程度的增高、貧血、糞便隱血陽性、紅細胞沉降率增快；急性出血性腸炎糞便普通培養可有大腸埃希菌、副大腸桿菌或銅綠假單胞菌生長，厭氧菌培養可有產氣莢膜桿菌生長。腸傷寒穿孔患者，血清肥達反應陽性；糞便培養陽性；可行傷寒桿菌培養。腸結核痰及糞便的結核桿菌檢查多呈陽性。
2.X線檢查
克羅恩病鋇劑胃腸造影是診斷的重要依據，小腸造影顯示小腸末端最有價值；急性出血性腸炎腹部X線片具有一定的診斷價值，早期病例可見到小腸積氣擴張、腸間隙增寬和氣液平面存在。病程進展后可見到腸壁內氣體，X線片出現不規則的致密陰影團提示發生腸段壞死，出現膈下游離氣體時則表明已并發腸穿孔。
3.其他
內鏡檢查、腹腔診斷性穿刺等。