1.神經檢查
有無視力障礙、視神經盤水腫、眼肌癱瘓、聽力減退、吞咽困難、肢體癱瘓、病理反射、肌張力改變、共濟失調、不自主動作（震顫、舞蹈樣動作、手足徐動）、感覺障礙、大小便潴留、失禁及腦膜刺激征等。
2.輔助檢查
（1）一般檢查
血、尿常規，血沉，腦脊液壓力、常規、生化、細胞學、免疫球蛋白（IgG、IgA、IgM）測定以及血混合玫瑰花環率測定。
（2）電生理檢查
腦電圖、腦誘發（視覺、聽覺、體感）電位。
（3）影像學檢查
腦CT或MRI檢查。
（4）病毒感染的免疫學檢查
用酶聯免疫吸附測定法或聚合酶鏈式反應方法檢測血及腦脊液中單皰病毒。取雙份血清作流行性乙型腦炎、腺病毒、麻疹病毒、脊髓灰質炎、流行性感冒病毒等的補體結合試驗、血凝抑制試驗以及腺病毒免疫熒光檢查、脊髓灰質炎中和試驗。
（5）腦活體組織檢查
免疫熒光檢查、病理組織學檢查。
