對于VRE的抗藥性的出現，一般都相信是與用在家畜飼料的抗生素作為治療病人的藥物有所關聯。具體來說，與萬古霉素相似而用在禽畜飼料上的阿伏霉素，能維持飼料的品質及家畜的生長而風行全球。由于家畜攝取了大量的抗生素，很自然地引起腸球菌的抗藥性。畜牧業者經由食用而感染了具有抗藥性的腸球菌，并在醫院接受萬古霉素的治療，而對萬古霉素的抗藥性亦由此而被發現。
由于這種原因，日本方面已禁止在飼料上添加阿伏霉素，且對食肉進行VRE的檢查。
