1.松果體區激素分泌性生殖細胞瘤患者，腦脊液內β-HCG、AFP水平增高。
2.腦脊液脫落細胞學檢查，對診斷生殖細胞瘤、松果體母細胞瘤最有價值。
3.現多根據臨床表現選擇CT或MRI檢查，CT是松果體腫瘤的首選檢查，可做增強及冠狀面掃描CT引導活檢，可于病灶局部獲取組織明確病理診斷。
4.MRI對松果體母細胞瘤診斷有獨到優點，松果體母細胞瘤惡性程度大，具有浸潤性、生長快、易轉移的特點，病人存活期短，因而早期診斷治療十分重要。MRI顯示松果體腫瘤區域的高信號以及清晰可見腫瘤侵入第三腦室的程度。
5.頭部放射線攝片顯示大塊（>15mm）的絮狀松果體鈣化或腦水腫征象。