果膠酶包括兩類,一類能催化果膠解聚,另一類能催化果膠分子中的酯水解。其中催化果膠物質解聚的酶分為作用于果膠的酶(聚甲基半乳糖、醛酸酶、醛酸裂解酶或者果膠裂解酶)和作用于果膠酸的酶(聚半乳糖醛酸酶、聚半乳糖醛酸裂解酶或者果膠酸裂解酶)。催化果膠分子中酯水解的酶有果膠酯酶和果膠酰基水解酶。