流感病毒經過飛沫傳播,侵入呼吸道,通過其HA吸附于呼吸道粘膜上皮細胞膜上的HA受體上,然后浸入這些細胞進行增殖。經1-2天的潛伏期,感染者即可出現流感癥狀。病毒在呼吸道粘膜上皮細胞內增殖,造成這些細胞變性,壞死脫落,粘膜充血水腫,腺體分泌增加;出現噴嚏、鼻塞、咳嗽等癥狀。病毒在上皮細胞內復制,很少入血,但可釋放內毒素樣物質入血,引起全身中毒癥狀:發熱、頭痛、全身酸痛、疲乏無力、白細胞數下降等。流感病毒感染一般數日內自愈,但幼兒或年老體弱病人易繼發細菌感染,如合并肺炎等,病死率高。