在牙齒生長發育期(懷孕后期、嬰兒期以及8歲前兒童)使用四環素類藥物，會造成永久性牙齒變色（黃－灰－褐）。
這種不良反應常見于長期使用本類藥物的患者，但短期內多次給藥的患者也發現此類不良反應。牙釉質發育不全也見報道。因此，除非其他藥物無效或禁用，該年齡段患者不適宜使用四環素類藥物。
表現為強度曬斑的光敏性反應已在服用四環素類藥物的人群中發現。易暴露于太陽光照和紫外燈照射的患者應注意服用四環素類藥物會發生該類反應，當皮膚有出現紅斑的癥狀時應馬上停止治療。
四環素類的抗代謝作用可以導致BUN的升高，但迄今為止的研究表明腎功能不全的患者使用多西環素不會發生此類反應。
同其他抗菌藥一樣，使用該藥會造成非敏感菌(包括真菌)的過度增長。如果發生二次感染，應停止使用，用合適的治療方法取代。
當懷疑性病與梅毒共存時，用藥前應進行暗視野檢查，并每月進行血清檢查，至少持續四個月。
由于四環素類能降低血漿凝血酶的活性，進行抗凝治療的患者應降低抗凝劑的用量。
在長期使用過程中，應定期進行各器官功能的檢查，如造血功能、腎功能和肝功能檢查。
所在A型β－溶血性鏈球菌引起的感染應至少治療10天。
由于抗菌藥會妨礙青霉素的抗菌作用，應避免與青霉素合用。