出血熱潛伏期一般為2～3周。典型臨床經過分為五期：發熱期、低血壓休克期、少尿期、多尿期及恢復期。
1.發熱期
主要表現為感染性病毒血癥和全身毛細血管損害引起的癥狀。
起病急，有發熱（38℃～40℃）、三痛（頭痛、腰痛、眼眶痛）以及惡心、嘔吐、胸悶、腹痛、腹瀉、全身關節痛等癥狀，皮膚黏膜三紅（臉、頸和上胸部發紅），眼結膜充血，重者似酒醉貌。口腔黏膜、胸背、腋下出現大小不等的出血點或淤斑，或呈條索狀、抓痕樣的出血點。
2.低血壓休克期
多在發熱4～6日，體溫開始下降時或退熱后不久，主要為失血漿性低血容量休克的表現。患者出現低血壓，重者發生休克。
3.少尿期
24小時尿量少于400ml，少尿期與低血壓期常無明顯界限。
4.多尿期
腎臟組織損害逐漸修復，但由于腎小管回吸收功能尚未完全恢復，以致尿量顯著增多。第8～12日多見，持續7～14天，尿量每天4000～6000ml左右，極易造成脫水及電解質紊亂。
5、恢復期
隨著腎功能的逐漸恢復，尿量減至3000ml以下時，即進入恢復期。尿量、癥狀逐漸恢復正常，復原需數月。