1、海綿竇感染和炎癥骨髓炎可為免疫受損狀態、糖尿病、乳突炎及副鼻竇感染的致命性并發癥。糖尿病及其他免疫系統缺陷患者可表現累及海綿竇和矢狀竇區的無痛性感染。糖尿病患者出現非特異性復視和頭痛應想到真菌或其他類型感染。免疫受損患者常合并真菌感染如白色念珠菌、新型隱球菌屬等，并常引起海綿竇血栓形成。球后蜂窩織炎或膿腫向后擴散也可累及海綿竇，這些患者通常有感染體征和眼球運動時劇烈疼痛，且有累及視神經的高度風險。
2、糖尿病性眼肌麻痹常見孤立的動眼、滑車或外展神經麻痹，CT或MRI檢查常無異常。動眼神經病變的特征是瞳孔回避，伴或不伴疼痛。瞳孔未受累常因神經的中央部梗死而位于周圍的瞳孔收縮纖維未受累所致。
3、痛性眼肌麻痹可出現于CST時，但須與Tolosa-Hunt綜合征、原發性或轉移性腫瘤、頸動脈-海綿竇瘺和動脈瘤等海綿竇其他病變鑒別。Tolosa-Hunt綜合征是影響海綿竇的特發性肉芽腫性炎癥，主要表現為眼肌麻痹、復視伴眼球后疼痛[3]。CST還須與眶部病變如眶部假瘤、鼻竇炎、腫瘤（原發性或轉移性）、感染（細菌或真菌）鑒別。與海綿竇病變不同，累及動眼神經的眼眶病變常伴視神經受累和突眼。眼眶病變與海綿竇病變臨床上有時難以區分，除非借助于MRI或CECT檢查[2]。檢查時應注意突眼的眼球望診和觸診（有助于確定眼眶或海綿竇前部病變）、眼球雜音聽診（可確定頸動脈-海綿竇瘺）以及評價糖尿病等。Tolosa-Hunt綜合征對皮質類固醇，如潑尼松60~100 mg/d口服反應頗佳。
4、復視的鑒別CST可出現復視，常見動眼、滑車、外展及三叉神經第1支，有時第2支同時受累。復視的病因很多，以下體征有助于病變定位和病因確定。