液態深層發酵法制醋是較為先進的技術，其特點是發酵周期短、勞動生產率高、勞動強度低、占地面積少、不用填充料等。它使我國古老的釀醋工業朝著機械化、管道化生產方向前進了一大步，為實現食醋生產自動化創造了條件，也使我國發酵醋酸技術跟上了國際先進水平。但由于釀醋周期短，風味欠佳，作為調味品食醋尚有不足。
1、濃度
發酵初始總濃度控制在5%～6%，待發酵完成用分割法取醋，即放出醋醪量1/3再加入酒醪1/3，維持相同總濃度繼續發酵，此后每隔20～22h再分割取醋一次，依次連續發酵至菌種衰退為止，正常情況可連續運行6～12個月。
2、消泡
醋酸發酵過程中時有泡沫產生，主要是由死亡醋酸菌體蛋白引發。為此發酵溫度要嚴格控制在36℃以下，絕不允許中斷通風。偶爾失控，要采取措施，防止泡沫逸出罐外或積累于罐中，在每次分割取醋時要把大部分泡沫除去。食醋是直接食品，不允許用化學消泡劑，必要時可使用少量植物油消泡，也可用機械消泡。
3、溫度
要嚴格控制發酵溫度，發酵旺盛期發酵熱高達11386kJ/ (m/h)。要特別注意冷卻降溫，必要時夏季用冷凍鹽水來控制溫度。
4、供氧
通風量一般為理論計算需氧量的2.8～3.0倍，發酵前、中、后期可根據發酵實際情況進行調節，但絕不能中斷供氧，否則導致菌體死亡。
5、提高食醋風味
深層液體發酵食醋風味差于固態法的主要原因是不揮發酸含量僅為固態法之15.7%，香氣中主要成分的乳酸乙酯幾乎為0，因此雖然液體法生產效率高，但食醋的風味必須改進。可采取如下措施：
①在酒精發酵中用乳酸菌與酵母菌混合發酵，以增加醋中乳酸含量，為產生乳酸乙酯創造條件；
②做好醋酸發酵醪壓濾前預處理工作。麩曲用量、后熟溫度和時間要嚴格控制，使在后熟發酵中蛋白質進一步水解成氨基酸，淀粉水解成單糖，有利于提高食醋的風味。