念珠菌屬占主要致病菌的80%以上,其中主要為白色念珠菌。但近年來,非白色念珠菌逐漸增多(如熱帶念珠菌、光滑念珠菌等)。其他常見的致病菌主要包括隱球菌、曲霉菌、毛霉菌、孢子絲菌、馬內菲青霉菌、組織胞漿菌、副球孢子菌和皮炎芽生菌等。感染途徑通常是血行播散和上行感染。